Идея довольно простая, встроенные коллекции (такие как All Systems) имеют лимитирующую коллекцию null, если просто смотреть их свойства в базе данных. Таким образом, достаточно изменить лимитирую коллекцию на null для любой коллекции.

Begin tran
Update collections_g set LimitToCollectionID = NULL where siteid = 'CollectionID'
Rollback Tran

Однако, есть и минусы, без лимитирующей коллекции в коллекцию может попасть что угодно, и необходимо быть крайне аккуратным при составлении правил для такой коллекции, кроме того, коллекция станет read-only после следующего цикла обновления членства (те, Вы должны назначить правила членства и только после этого убирать лимитирующую коллекцию).